马来西亚南方学院共成立八个学部，为学生们提供了25项课程，其中包括了16个文凭课程、4个双联学士课程、3个大学基础课程和2个证书课程。
留学360介绍，马来西亚南方学院旨在为学生提供一个愉快的学习环境，有其使命的重量，她是大马华族民办学院的先锋，要继承优秀的民族文化传统，又要为民族、社稷、国家乃至地球村培养英才。南方学院学系和课程的设置配合工业化的发展 ，为国家人力资源的栽培作出贡献。
企业与管理学院
商业管理硕士 (PA4746)
会计（荣誉）学士学位 (PA2781)
金融与投资（荣誉）学士学位 (PA2780)
市场行销（荣誉）学士学位 (PA2807)
商业管理（荣誉）学士学位 (PA4715)
会计专业文凭 (A10799)
企业管理专业文凭 (A5189)
国际贸易专业文凭 (A5806)
市场行销专业文凭 (A5807)
物流管理专业文凭 (A7838)
金融分析专业文凭 (A9222)
3+0 商业管理（荣誉）学士学位（英国迪塞大学）(A10923)
工程与资讯学院
软件工程（荣誉）学士学位 (PA2810)
电子工程（荣誉）学士学位 (PA4009)
资讯科技专业文凭 (A10844)
电脑科学专业文凭 (A8297)
电机与电子工程专业文凭 (A1605)
人文与社会学院
中文（荣誉）学士学位 (PA2808)
英文（荣誉）学士学位 (PA2787)
马来文（荣誉）学士学位 (PA2786)
大众传播（荣誉）学士学位 (PA2809)
中文专业文凭 (A9858)
英文专业文凭 (A7606)
马来文专业文凭 (PA1573)
新闻与传播专业文凭 (A6814)
学前幼儿教育专业文凭 (N/143/4/0084)
艺术与设计学院
电脑绘制（荣誉）学士学位 (PA2857)
工业设计专业文凭 (A6743)
广告设计专业文凭 (A7366)
视觉艺术专业文凭 (PA10426)
多媒体专业文凭 (PA3151)
中医药学院
3+2 中医双联学士学位(中国天津中医药大学) (A10709)
大学基础学部
文科大学基础课程 (MQA / FA2249)
理科大学基础课程 (MQA / FA2142)
中医药大学基础课程 (A11300)
旅游与酒店管理学部
旅游与酒店管理课程
专业与推广教育学部
专业行政文凭
终身学习证书班
沈慕羽华教与师资培训中心
汉语国际教育专业文凭课程（与新加坡南洋理工大学孔子学院合办）
中国哲学（中华文化）硕士班（与中国华侨大学合作）
艺术教育学硕士班（与台湾彰化师范大学合作）
